מולקולת המים H20 מורכבת ממספר שווה של יוני מימן +H ויוני הידרוקסיל -OH.

במצב כזה המים ניטרליים. אם מוסיפים למים חומצה המכילה יוני מימן, היא תתפרק והתוצאה תהיה עליית ריכוזם של יוני המימן בתמיסה. במצב כזה התמיסה היא חומצית. לעומת זאת, אם מוסיפים למים תרכוב המכילה יוני הידרוקסיל, עולה ריכוזם של יוני ההידרוקסיל והתמיסה תהפוך בסיסית.
גם הקרקע נתונה לשינויים בערכי החומציות שלה בהתאם לפעילות המתרחשת בה. פעילות של חיידקים אנאירוביים בקרקע, או חוסר אוורור בה, מעלים את רמת החומציות בקרקע.